液體菌種替代固體菌種的趨勢已經被大家認可了，現在越來越多的工廠開始使用液體菌種進行生產，雖然液體菌種各項生產指標都優于固體菌種，但是液體菌種的風險性卻逐漸被人們所忽視。液體菌種接種前一定要經過嚴格的檢測才能夠使用，但是更重要的是一旦發酵罐出現染菌，一定要盡快分析出染菌的原因，并加以解決。要分析染菌的原因得從每一個環節出現染菌的表現說起，反過來，當出現染菌，我們就能找到是哪個環節出現問題了。
1、滅菌
全自動發酵罐滅菌不*引起的染菌會在里2-3天內表現出來，表現是培養液逐漸變得渾濁，菌球形成和生長變慢，不同細菌從排氣味道上表現的程度有所不同，必須要注意的是如果培養的是低溫品種，如金針菇，有表現的時間會延后，甚至到接種前從宏觀上也沒有明顯的表現，只有通過檢測才能確定已經感染細菌了。引起發酵罐滅菌不*的原因主要在滅菌鍋（韓式發酵罐），單體罐只要在滅菌過程的操作上。
解決辦法：全自動發酵罐，檢查滅菌鍋程序、管路、電磁閥（氣動閥）、溫度傳感器、壓力傳感器等。單體發酵罐，檢查冷空氣是否排凈、管路滅菌是否達標等。經過排查還不能解決，就需要適當增加滅菌時間或者滅菌溫度。
2、冷卻
冷卻過程引起染菌主要是因為冷卻過程到壓力“0”以前沒有及時給發酵罐進氣，造成負壓，雖然管路都安裝有單向閥，但是要知道單向閥不是的，而且單向閥使用時間久了出現故障的可能性很高。一般因為冷卻引起的染菌幾率不高，染菌表現出來的時間比滅菌不*引起的染菌要晚一些。
解決辦法：全自動發酵罐冷卻時安排專人負責，避免出現負壓的情況，加強發酵罐管件的日常檢查維護。
3、接種
全自動發酵罐接種的過程是罐體開放與外界連通的過程，是危險的環節，接種引起的染菌表現嚴重時會很快，在1-2天就有可能表現出來，主要是人員操作不當所引起，食用菌層流罩凈化效果下降也會引起染菌。
解決辦法：加強接種人員的操作技能，要制定出操作規程；定期檢查接種層流罩的凈化效果，必要時每天對層流罩進行平板沉降檢測。
4、氣源
氣源引起發酵罐染菌表現出來的時期不確定，沒有規律，同時氣源帶菌的輕重對染菌表現也有輕重之分。特別是氣源進水引起的影響大，氣源引起染菌有一個大特點是不同天數的發酵罐同時表現染菌。
解決辦法：每天或者定期對無菌空氣質量進行檢測，加強無菌空氣系統設備的巡檢工作。氣源長時間中斷也會對液體菌種生長造成影響，但一般不會引起染菌。
5、三角瓶菌種
三角瓶菌種不純會直接導致發酵罐染菌，表現的時期也很早，快天就會出現劇烈的表現，這種情況出現的幾率不是很大，但是也要對三角瓶菌種的純度給予足夠的重視，一個合格的液體菌種技術員不單是發酵罐做的好，制作試管母種和三角瓶的水平也很重要。
一、全自動發酵罐的維護
1、發酵罐精密過濾器，一般使用期限為半年。如果過濾阻力太大或失去過濾能力致影響正常生產，則需清洗或更換（建議直接更換，不作清洗，因清洗操作后不能可靠保證過濾器的性能）。
2、清洗發酵罐時，請用軟毛刷進行刷洗，不要用硬器刮擦，以免損傷發酵罐表面。
3、發酵罐配套儀表應每年校驗一次，以確保正常使用。
4、發酵罐的電器、儀表、傳感器等電氣設備嚴禁直接與水、汽接觸，防止受潮。
5、發酵罐停止使用時，應及時清洗干凈，排盡發酵罐及各管道中的余水；松開發酵罐罐蓋及手孔螺絲，防止密封圈產生變形。
6、全自動發酵罐的操作平臺、恒溫水箱等碳鋼設備應定期（一年一次）刷油漆，防止銹蝕。
7、經常檢查減速器油位，如潤滑油不夠，需及時增加。
8、定期更換減速器潤滑油，以延長其使用壽命。
9、如果發酵罐暫時不用，則需對發酵罐進行空消，并排盡罐內及各管道內的余水。
二、全自動發酵罐使用注意事項
1、必須確保發酵罐的所有單件設備能正常運行時使用本系統。
2、在消毒過濾器時，流經空氣過濾器的蒸汽壓力不得超過0.17MPa，否則過濾器濾芯會被損壞，失去過濾能力。
3、在發酵過程中，應確保罐壓不超過0.17MPa。
4、在實消過程中，夾套通蒸汽預熱時，必須控制進汽壓力在設備的工作壓力范圍內（不應超過0.2MPa），否則會引起發酵罐的損壞。
5、在空消及實消時，一定要排盡發酵罐夾套內的余水。否則可能會導致發酵罐內筒體壓扁，造成設備損壞；在實消時，還會造成冷凝水過多導致培養液被稀釋，從而無法達到工藝要求。
6、在空消、實消結束后冷卻過程中，嚴禁發酵罐內產生負壓，以免造成污染，甚至損壞設備。
7、在發酵過程中，發酵罐的罐壓應維持在0.03～0.05MPa之間，以免引起污染。
8、在各操作過程中，必須保持空氣管道中的壓力大于發酵罐的罐壓，否則會引起發酵罐中的液體倒流進入過濾器中，堵塞過濾器濾芯或使過濾器失效。
9、如果遇到自己解決不了的問題請直接與全自動發酵罐的售后服務部門聯系。請勿強行拆卸或維修發酵罐。
